Фонд доверительного управления является плательщиком подоходного налога с юридических лиц. Предметом налогообложения не является прибыль фонда доверительного управления от передачи имущества в фонд доверительного управления и увеличения имущества фонда доверительного управления по договору или завещанию.
Для целей закона о подоходном налоге считается, что фонд доверительного управления, учрежденный в соответствии с законодательством ЧР, имеет место нахождения на территории ЧР, и следовательно, является налоговым резидентом ЧР. На налоговых резидентов ЧР возлагается обязанность по уплате налогов, которая распространяется как на доходы, источник которых расположен на территории Чешской Республики, так и на доходы, поступающие из зарубежных источников.